江苏16所高校作为主要完成单位共荣获国家科学技术奖通用项目28项（其中主持15项），占全国高校通用项目获奖总数的15.7%，获奖数量位居全国省市区第二。

全省高校获2016年国家自然科学奖4项，占全国高校自然科学奖获奖数的12.5%。其中南京大学、东南大学作为第一完成单位各荣获自然科学二等奖一项。

全省高校获2016年国家技术发明奖通用项目8项，占全国高校技术发明奖通用项目获奖数的19.5%。其中南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、河海大学作为第一完成单位各荣获技术发明二等奖一项。

全省高校获2016年国家科学技术进步奖通用项目16项，占全国高校科学技术进步奖通用项目获奖数的15.2%。其中河海大学作为第一完成单位荣获科技进步一等奖一项，南京大学作为第一完成单位荣获科技进步二等奖两项，东南大学、中国药科大学、南京林业大学、中国矿业大学、苏州大学作为第一完成单位各荣获科技进步二等奖一项。