南京医科大学以“国旗下的思政课”作为开展爱国主义教育的重要载体，邀请名医名师、时代榜样、先进典型等为学生讲述学校师生与党和国家同向同行，与时代发展、民族复兴同频共振的故事，传播医者仁心，彰显使命担当。

强化党建引领，成长导师到身边讲红色故事。学校为每个班级配备一名成长导师，每学期初，结合每周一的主题升旗仪式，由成长导师担任主讲，为学生讲授信仰公开课，并结合学校发展中的红色故事，加强校史教育，引领学生全面了解学校与祖国共奋进的担当故事，鼓励学生明辨、笃行、慎思、博学，以崇高远大的理想抱负、自律坚毅的道德品质、求实创新的探索精神，不负韶华、不负时代、不负人民。

强化榜样引领，身边典型进校园讲奋斗担当。学校将“国旗下的思政课”打造为学生学先进、争先锋、树典型的榜样公开课。国庆期间，邀请学校“时代楷模”团队代表讲南医人的使命担当；“七一”邀请学校“全国优秀共产党员”代表，为学生讲授共产党人的坚守与信念；“五四”青年节期间，邀请学校“五四”青年奖章获得者分享扎根祖国沃土，坚守科研一线的奋斗故事。通过身边榜样的故事、经历，教育引领学生勇攀科研高峰,胸怀报国之志，成长为大有可为的新时代南医人。

强化专业引领，朋辈伙伴走上台讲接力传承。学校结合医学生的专业教育，邀请学科领域专家、名医名师、最美医务工作者、最美大学生、自强之星等，与学生同站国旗下，通过共读故事、齐诵诗歌等形式，传递青年师生“强国有我”的坚毅、自信，教育青年医学生强化专业认同、夯实专业知识，投身医学事业，以奋斗拼搏的姿态，续写新时代的“南医故事”，为健康中国、民族复兴贡献青春力量。